Õpilasel on võimalik kolme õppeaasta jooksul igal aastal ühe korra suunamoodulit valida. Iga õppeaasta suunamoodul koosneb kolmest kursusest. Kokku läbitakse kolme aasta jooksul üheksa kursust. Õpilane võib valida igal aastal sama suunamooduli, aga võib seda ka vahetada. Suunamoodulite süsteem suurendab õpilase valikuvabadust oma õpitee planeerimisel.
Moodulites on kohtade arv piiratud. Õpilaste valik moodulisse toimub läbi kolme eelistuse registreerimise iga õppeaasta alguses ning läbi varasema eduka õppetöö suunamoodulis, juhul kui on soov jätkata samal suunal.
Õppemooduli valiku teeb G1 õpilane esimese õppeperioodi alguses. G2 ja G3 õpilased teevad valiku järgmiseks õppeaastaks õppeaasta lõpus.